Sve do polufinala igra se po jedna utakmica, a u polufinalu se igraju dvije utakmice. U finalu će se igrati jedna utakmica, a odluka o domaćinstvu finala bit će donesena prije polufinalnih utakmica.
Parovi 1/16 finala Kupa BiH:
NK Travnik – FK Borac Banja Luka
FK Rudar Prijedor – FK Olimpik Sarajevo
FK Goražde – FK Sloboda Tuzla
FK Radnički Lukavac – FK Sarajevo
FK Sloboda Bosanski Novi – FK Tuzla City
FK Budućnost Banovići – FK Željezničar Sarajevo
FK Tekstilac Derventa – HŠK Zrinjski Mostar
FK Dizdaruša Brčko – FK Velež Mostar
FK Slavija Istočno Sarajevo – FK Mladost Doboj kod Kaknja
NK GOŠK Gabela – NK Široki Brijeg
NK Zvijezda Gradačac – FK Radnik Bijeljina
FK Leotar Trebinje – FK Krupa na Vrbasu
FK Zvijezda 09 Bijeljina – FK Alfa Modriča
FK Klis Buturović Polje – FK Unis Vogošća
FK Velež Nevesinje – FK Igman Konjic
NK Fortuna Zenica – FK Rudar Kakanj
Utakmice 1/16 finala Kupa Bosne i Hercegovine igraju se 30. septembra.
Zbog situacije s pandemijom koronavirusa žrijebanje parova održano je bez prisustva medija uz prijenos na zvaničnom YouTube kanalu Nogometnog saveza Bosne i Hercegovine.
